Penyakit Kawasaki yang tidak segera ditangani dapat menyebabkan berbagai kondisi yang sangat serius, seperti: - Peradangan pembuluh darah jantung - Peradangan pada otot jantung miokarditis - Masalah pada katup jantung - Peningkatan denyut jantung takikardia - Peradangan lapisan membran jantung perikarditis Peradangan pada pembuluh darah jantung dapat menyebabkan dinding pembuluh darah melemah.
Diperlukan sekitar 3 minggu hingga anak kembali dalam kondisi normal.
Hanya saja, belum diketahui secara pasti bakteri atau virus patogen apa yang menimbulkan penyakit kawasaki.